Les jeunes filles

Pour les jeunes filles, le site de leur école se situait dans l'ancien couvent des Clarisses, qui est aujourd'hui l'école de l'Immaculée Conception. Les Clarisses-urbanistes sont installées au faubourg dès le XIVe siècle. Leur couvent détruit lors des guerres de religion est reconstruit rue Sainte-Claire en 1617. C'est en 1695 qu'elles sont le plus nombreuses, soit 27 : elles s'occupent alors de l'éducation des jeunes filles de la noblesse et de la bourgeoisie. Pour les mêmes raisons que le couvent des Carmes, la confiscation des biens du clergé pendant la période révolutionnaire de la fin du XVIIIe siècle, le couvent est saisi en 1792 puis transformé en prison. Il est acheté en 1796 puis rapidement cédé à la commune. C'est en 1819 que les Sœurs de Nevers installent dans l'ancien couvent des Clarisses une école primaire et un pensionnat qui subsistera jusqu'en 1903. Elles doivent alors quitter Lectoure pour les mêmes raisons que les frères.
Des Ursulines, des enseignantes laïques, les Sœurs de la congrégation lorraine Sainte Chrétienne de Metz après 1940 (repliées à Lectoure suite à la destruction de leurs bâtiments conventuels lors d'un bombardement, appelées par l'archiprêtre SENTEX - cf. ci-dessous - elles enseigneront à l'Immaculée Conception jusqu'en 1948) et enfin les Religieuses de la Providence prennent successivement le relais et font vivre cet établissement jusqu'en 1962, date à laquelle l'école de garçons et celle de filles fusionnent.