De 1901 à 1936
Les lois d'interdiction de l'enseignement congréganiste (1901) et de séparation de l'Église et de l'État (1905) contraignent les frères à quitter Lectoure. En 1906, un prêtre séculier du diocèse d'Auch, l'Abbé TOURNIER, prend en main les destinées de l'établissement, sous le titre de "vicaire instituteur". Il ouvre alors une école primaire et en 1936 il fait de Saint Joseph une école secondaire préparant au baccalauréat.